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腸道菌群——你所不知道的人體“第二基因組”

2014-06-11 15:53

你知道剛剛過(guò)去的5月29日是什么日子嗎?

1958年,世界腸道健康組織(WGO)創(chuàng)始人Henry Cohen博士提出,5月29日這一天將永久的成為“世界腸道健康日。2005年5月29日,WGO的研究人員與來(lái)自世界各地的胃腸道學(xué)者齊聚一堂,舉行了第一次腸道健康研討會(huì)。5年后,中國(guó)食品科學(xué)技術(shù)學(xué)會(huì)(CIFST)于北京召開(kāi)的第五屆“乳酸菌與健康”國(guó)際研討會(huì)上,將“世界腸道健康日”這個(gè)概念引入中國(guó),旨在提升公眾的腸道健康意識(shí)。

腸道中與人體共生或寄生的微生物如細(xì)菌、原生動(dòng)物、病毒等可被稱為人類的“第二基因組”,“第二基因組”有著龐大數(shù)量和類群基礎(chǔ)的細(xì)菌,其分布平衡對(duì)人體健康尤為重要。一些常見(jiàn)的疾病包括糖尿病、哮喘、慢性腹瀉、腸易激綜合癥(IBS)、炎癥性腸道?。↖BD)、肥胖癥、免疫力低下等都被發(fā)現(xiàn)與細(xì)菌分布平衡的失調(diào)有密切關(guān)聯(lián)。隨著細(xì)菌種群分布臨床研究調(diào)查的深入,這些與人體健康密切相關(guān)的菌群的功能將越來(lái)越多被認(rèn)知。而準(zhǔn)確、快速地獲得樣本細(xì)菌的組成信息對(duì)腸道疾病研究具有重要意義。

作為一家以基因組服務(wù)為核心的全球公司,菌群檢測(cè)服務(wù)是金唯智的核心業(yè)務(wù)之一。服務(wù)內(nèi)容主要包括幫助臨床研究人員分析菌群種類和分布數(shù)據(jù),揭示菌群特征與健康的關(guān)聯(lián),協(xié)助制定相應(yīng)的疾病治療或健康管理方案等。生物谷前不久在世界腸道健康日之際,圍繞腸道菌群失調(diào)導(dǎo)致的常見(jiàn)疾病及菌群檢測(cè)服務(wù)等問(wèn)題專訪了金唯智(GENEWIZ,Inc.) 副總裁胡光輝博士,以讓讀者更好地了解腸道健康知識(shí)及提高腸道健康意識(shí)。以下為本次專訪記錄。

胡光輝博士

生物谷:每年的5月29日被世界腸道健康組織(WGO)創(chuàng)始人Henry Cohen博士定為“世界腸道健康日”,關(guān)于人體腸道健康知識(shí),現(xiàn)代人們對(duì)此認(rèn)知水平如何?

胡光輝:很多人以為腸道的作用僅僅是消化吸收營(yíng)養(yǎng)素和排泄廢物。確實(shí),腸道是人體最大的“加油站”和“排污廠”。人體所需要和產(chǎn)生的90%以上的營(yíng)養(yǎng)素及廢物是由腸道消化吸收和排出的。人的一生中,腸道平均要處理20多噸食品和3萬(wàn)公升液體。但腸道對(duì)人類健康的作用遠(yuǎn)不止這些。腸道還是人體最大的疾病防御堡壘和免疫器官。這個(gè)管道是對(duì)外界環(huán)境是開(kāi)放的,這導(dǎo)致外界的細(xì)菌、病毒和毒素等很容易入侵腸道。為了抵御經(jīng)口進(jìn)入的大量致病菌的侵襲,人體70%以上的免疫細(xì)胞都位于腸黏膜內(nèi),其所含的淋巴細(xì)胞數(shù)量遠(yuǎn)高于其它淋巴組織。另外,腸道是人體的“第二大腦”,它有1億以上的神經(jīng)元,能夠獨(dú)立運(yùn)作,自主判斷,發(fā)號(hào)施令。如果腸道患有疾病,會(huì)給大腦帶來(lái)不良影響。

值得特別指出的是,腸道除了腸體以外,還生存著超過(guò)百萬(wàn)億的微生物,兩者的互動(dòng)平衡保證了腸道整體的健康。其中,微生物包含了細(xì)菌、原生動(dòng)物以及病毒等,被稱為人體“第二基因組”?,F(xiàn)在,人們可能已經(jīng)了解人體基因的重要性及人體基因組計(jì)劃,而對(duì)腸道微生物所代表的人體“第二基因組”認(rèn)識(shí)卻不多。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究證據(jù)表明,腸道微生物尤其是細(xì)菌分布的平衡對(duì)人體的健康非常重要。隨著科學(xué)研究的深入和知識(shí)普及,人們對(duì)腸道菌群的認(rèn)知也在加強(qiáng)。一個(gè)健康的人不僅應(yīng)當(dāng)有健康的體魄,還應(yīng)當(dāng)具備健康的腸道菌群。

生物谷:腸道菌群失調(diào)可能會(huì)導(dǎo)致哪些常見(jiàn)的疾?。?能否舉例說(shuō)明某些疾病由哪些特定細(xì)菌分布失衡引發(fā)?生活中我們?cè)撛鯓颖Pl(wèi)腸道?

胡光輝:菌群失調(diào)會(huì)導(dǎo)致一系列的健康問(wèn)題,包括腸道疾病(比如克羅恩病、腸易激綜合征、便秘、腹瀉、脹氣、消化不良等)、代謝綜合癥(高血脂、高血壓、肥胖、糖尿?。?、免疫力低下、心臟病、營(yíng)養(yǎng)不良、過(guò)敏、哮喘、癌癥和精神疾病(比如抑郁癥、自閉癥)。目前的研究大部分還集中在整體菌群失調(diào)對(duì)這些常見(jiàn)疾病的影響,尚沒(méi)有太多與特定細(xì)菌分布失衡相關(guān)的報(bào)道。但隨著這方面研究的不斷深入,疾病與特定細(xì)菌之間的相關(guān)性也越來(lái)越多的被發(fā)現(xiàn)。比如中國(guó)科學(xué)家在2012年首次發(fā)現(xiàn)一種叫做陰溝腸桿菌的腸道細(xì)菌是造成肥胖的直接元兇之一,它在人的腸道里過(guò)度生長(zhǎng)是肥胖的原因,而不是結(jié)果。這也是國(guó)際上首次證明腸道細(xì)菌與肥胖之間具有直接因果關(guān)系。

在生活中,多食粗糧和水果,少吃葷腥食品和腌制食品,以及避免服用或注射光譜抗生素,盡量選擇針對(duì)性抗生素,適當(dāng)補(bǔ)充益生菌和益生元產(chǎn)品,都有益于維護(hù)腸道的菌群健康分布。

生物谷:隨著對(duì)細(xì)菌種群分布調(diào)查臨床研究的深入,金唯智推出了FloraCheckTM菌群檢測(cè)服務(wù),能否簡(jiǎn)要介紹下該檢測(cè)技術(shù)?開(kāi)發(fā)此項(xiàng)技術(shù)的難點(diǎn)在哪里?

胡光輝:FloraCheckTM主要針對(duì)細(xì)菌基因的一些高度可變區(qū)域,使用我們自主開(kāi)發(fā)的特殊引物進(jìn)行擴(kuò)增和均勻覆蓋,然后通過(guò)新一代測(cè)序方法獲得基因序列,經(jīng)與菌種數(shù)據(jù)庫(kù)序列比對(duì)和生物信息學(xué)分析后,確定樣品的菌種組成,相對(duì)含量和多樣性。其技術(shù)難點(diǎn)在于,如何設(shè)計(jì)合適的引物組合,既能全面測(cè)出各種菌種,又能真實(shí)反映他們的相對(duì)含量。

生物谷:金唯智FloraCheckTM菌群檢測(cè)服務(wù)和市場(chǎng)上同類產(chǎn)品相比具有哪些優(yōu)勢(shì)?主要應(yīng)用于哪些細(xì)分領(lǐng)域?

胡光輝:FloraCheckTM的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在兩個(gè)方面:檢測(cè)技術(shù)和解讀報(bào)告。檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)包括自主設(shè)計(jì)的多引物大大提高了檢測(cè)的靈敏度和對(duì)相似細(xì)菌的區(qū)分,可檢測(cè)出低豐度的細(xì)菌;檢測(cè)結(jié)果重現(xiàn)性好,確保無(wú)序列偏好,客觀反應(yīng)品菌種組成和相對(duì)含量。解讀報(bào)告依據(jù)最新和最全面的醫(yī)學(xué)研究進(jìn)展,綜合菌群多樣性和菌群種類與健康關(guān)聯(lián),提供可行的健康管理建議。

FloraCheckTM可應(yīng)用于各種樣本的菌群分析,包括對(duì)人體腸道、口腔、體表、泌尿系統(tǒng)等部位的菌群分析,尤其可幫助亞健康人群、消化系統(tǒng)疾病、糖尿病或肥胖癥等患者,通過(guò)確定和實(shí)時(shí)跟蹤腸道菌群狀態(tài),結(jié)合合理的干預(yù)措施,幫助患者腸道早日回歸菌群生態(tài)平衡,從而改善健康狀況,提高生活質(zhì)量。

生物谷:目前的腸道菌群研究熱點(diǎn)有哪些?怎樣看待腸道菌群在疾病治療和健康管理方面的前景?

胡光輝:目前腸道菌研究主要包括三個(gè)方面:菌群變化與疾病/健康的相關(guān)性;腸道菌對(duì)藥物代謝和個(gè)性化治療的影響;通過(guò)對(duì)腸道菌的干預(yù)來(lái)達(dá)到治療的目的(這包括糞菌移植、特制菌藥丸等)。這些臨床科學(xué)研究非常重要,不但極大程度的增加了我們對(duì)人體與腸道共生細(xì)菌的認(rèn)識(shí),還幫助我們?cè)O(shè)計(jì)合理的菌群干預(yù)方案。在疾病治療和健康管理方面,預(yù)計(jì)在不久的將來(lái),將逐步走向個(gè)性化,菌群干預(yù)產(chǎn)品也會(huì)多樣化。比如根據(jù)腸道菌群的檢測(cè)結(jié)果,可以選擇正對(duì)性的益生菌進(jìn)行干預(yù)。

生物谷:除了FloraCheckTM菌群檢測(cè)服務(wù),金唯智還提供哪些與健康相關(guān)的業(yè)務(wù)?

胡光輝:作為國(guó)際領(lǐng)先的全球性基因組服務(wù)公司,金唯智有世界一流的研發(fā)團(tuán)隊(duì)。在基因組臨床應(yīng)用方面,我們除了FloraCheckTM菌群檢測(cè)服務(wù)之外,我們最近還推出了PGxOneTM藥物基因組檢測(cè),該檢測(cè)平臺(tái)已獲得美國(guó)CLIA實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)和CAP認(rèn)證;PGxOneTM通過(guò)全面檢測(cè)與藥物使用相關(guān)的基因,幫助臨床醫(yī)生確定個(gè)體最佳的藥物或其使用劑量,避免毒副作用。在癌癥基因組檢測(cè)方面,我們的OncoGxOneTM Plus平臺(tái)是目前世界上唯一可以為個(gè)性化靶向用藥、化療用藥和細(xì)胞免疫治療提供指導(dǎo)信息的癌癥基因檢測(cè)技術(shù)。除了臨床應(yīng)用之外,OncoGxOnTM  Plus也可用于癌癥的標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)和機(jī)理研究。另外,我們正在開(kāi)發(fā)一系列的癌癥無(wú)創(chuàng)早期篩查和監(jiān)控,即通過(guò)對(duì)無(wú)創(chuàng)樣品如血液、尿液、糞便和宮頸刮片等深度分析癌癥相關(guān)基因的突變信息,達(dá)到早期檢測(cè)和治療后跟蹤監(jiān)控。(生物谷Bioon.com)

胡光輝簡(jiǎn)介

留美生物醫(yī)學(xué)博士,現(xiàn)任金唯智(GENEWIZ, Inc.) 副總裁和全球轉(zhuǎn)化基因組學(xué)業(yè)務(wù)負(fù)責(zé)人,之前擔(dān)任國(guó)際知名藥物公司默克/ 默沙東 (Merck & Co.) 副總監(jiān)、葛蘭素史克 (GlaxoSmithKline) 研究員和主任科學(xué)家、以及美國(guó) Tanox 生物制藥公司科學(xué)家 (注:該公司已并入基因泰克(Genentech)/羅氏(Roche)),主要致力于結(jié)構(gòu)生物學(xué)、生物信息學(xué)和基因組學(xué)的研究和它們?cè)谒幬镩_(kāi)發(fā)、病理診斷和個(gè)體化治療方面的應(yīng)用。胡博士1992 年畢業(yè)于清華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)系,1995年獲中國(guó)科學(xué)院生物物理專業(yè)碩士學(xué)位;2000年獲美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院 (Baylor College of Medicine) 結(jié)構(gòu)計(jì)算生物學(xué)和分子物理學(xué)博士學(xué)位,隨后在美國(guó)加州大學(xué) (UCLA) 從事生物信息學(xué)的博士后研究。胡博士至今發(fā)表的論文/著作/國(guó)際專利幾十篇/項(xiàng),10個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)被收入國(guó)際PDB數(shù)據(jù)庫(kù),超過(guò)5萬(wàn)個(gè)遺傳變異位點(diǎn)(SNP)被收入國(guó)際dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)。胡博士多次受邀在大學(xué)和國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議上發(fā)表演講,擔(dān)任會(huì)議主席、組委和顧問(wèn),以及學(xué)術(shù)論文、美國(guó)國(guó)立健康研究院 (NIH)/美國(guó)國(guó)立癌癥研究所(NCI) 資助項(xiàng)目的評(píng)審。胡博士現(xiàn)為Sigma Xi Society、美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(ASCO)等組織的會(huì)員,以及清華生物醫(yī)藥協(xié)會(huì)的會(huì)長(zhǎng)。胡博士曾在國(guó)際著名的沃頓商學(xué)院 (The Wharton Business School) 獲得過(guò)管理和市場(chǎng)方面的培訓(xùn),并于2007-2011年在美國(guó)創(chuàng)辦新世紀(jì)醫(yī)學(xué)公司 (New Century Medicine, Inc.),領(lǐng)導(dǎo)開(kāi)發(fā)了“健康與疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估系統(tǒng)”。

消息來(lái)源:生物谷