北京2019年11月18日 /美通社/ -- 11月16日由江蘇省生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會(huì)生物信息學(xué)專業(yè)委員會(huì)主辦,南京醫(yī)科大學(xué)承辦的第九屆江蘇省生物信息學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)論壇在南京醫(yī)科大學(xué)至誠(chéng)樓中順利召開。此次會(huì)議以“生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)”為主題,會(huì)議上特邀南京醫(yī)科大學(xué)李建清教授、北京基因組研究所特聘研究員章張教授等多為知名生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)專家進(jìn)行主題報(bào)告的演講,生物信息學(xué)及相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)者、研究生、在校大學(xué)生近300余人參與到會(huì)議當(dāng)中,場(chǎng)面異常火爆,學(xué)術(shù)氛圍濃厚。
Bigtera(大兆)作為南京醫(yī)科大學(xué)在生物信息大數(shù)據(jù)分析上的合作伙伴,有幸受邀參與了此次論壇, Bigtera(大兆)研發(fā)總監(jiān)李銅舒先生圍繞本次論壇的主題“生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)”作為演講嘉賓進(jìn)行了《面向?qū)ο蟮能浖x存儲(chǔ)及并行分析系統(tǒng)》的主題匯報(bào)演講,從Bigtera(大兆)自身產(chǎn)品平臺(tái)出發(fā),講述了Bigtera和生物信息大數(shù)據(jù)的緣分故事。
4V時(shí)代,生物信息學(xué)對(duì)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的需求和挑戰(zhàn)
在本次學(xué)術(shù)論壇中,很多生物信息領(lǐng)域的專家都提及生物醫(yī)學(xué)信息已經(jīng)進(jìn)入了大數(shù)據(jù)時(shí)代。數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)庫(kù)可以幫助更多的學(xué)校、實(shí)驗(yàn)室、醫(yī)院、專家、學(xué)者等進(jìn)行專業(yè)病理的臨床研究和學(xué)術(shù)研究等。在大數(shù)據(jù)時(shí)代,數(shù)據(jù)具有4V特性:Volume、Variety、Velocity、Value,但無論前三種特性如何變化,最終要服務(wù)于Value(科學(xué)價(jià)值),為了實(shí)現(xiàn)最大化的科學(xué)價(jià)值,生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析就對(duì)IT的架構(gòu)提出了更多更高的要求,例如對(duì)工具和環(huán)境、存儲(chǔ)性能、復(fù)合人才、數(shù)據(jù)安全和工作協(xié)同等方面的要求。
李銅舒介紹到除了要滿足上述面臨的要求,現(xiàn)階段生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析發(fā)展中同時(shí)也面臨著更多的實(shí)際挑戰(zhàn)和問題,包括如何利用現(xiàn)有的硬件資源、在基因測(cè)序數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜應(yīng)用場(chǎng)景中如何節(jié)省人力資源、如何解決缺少有效管理和流程定義工具、如何在有限的科研資金下進(jìn)行按需部署等。這些挑戰(zhàn)和問題是我們企業(yè)應(yīng)該協(xié)助整個(gè)生物信息大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè),從平臺(tái)工具和存儲(chǔ)技術(shù)基礎(chǔ)架構(gòu)方面進(jìn)行思考和解決的。從而滿足從大型科研院校、醫(yī)院到中小型科研團(tuán)隊(duì)、實(shí)驗(yàn)室及專家學(xué)者個(gè)人使用的多種場(chǎng)景需求。
現(xiàn)在在生物信息大數(shù)據(jù)分析行業(yè)中普遍采用的計(jì)算分析模式是Job Queue,具有開發(fā)簡(jiǎn)單快速、工具算法支持簡(jiǎn)潔靈活、維護(hù)成本低、并行性強(qiáng)等特性,除了計(jì)算資源的管理和框架之外,軟件定義存儲(chǔ)系統(tǒng)可以更好的解決傳統(tǒng)磁盤陣列的問題并滿足對(duì)數(shù)據(jù)擴(kuò)容、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、故障處理、數(shù)據(jù)調(diào)度和管控等方面的需求,是比傳統(tǒng)的存儲(chǔ)方式更理想的、更適合于生物信息大數(shù)據(jù)分析研究的存儲(chǔ)方式。
Bigtera(大兆)軟件定義存儲(chǔ)助力生物信息數(shù)據(jù)管理與分析
滿足了硬件層面和IT調(diào)度層面的挑戰(zhàn)需求是否就真正滿足了生物信息大數(shù)據(jù)分析的需求?很顯然這是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。生物信息大數(shù)據(jù)的分析是比其他行業(yè)的計(jì)算分析和存儲(chǔ)應(yīng)用更加復(fù)雜的技術(shù)研究。在行業(yè)的擴(kuò)展中 Bigtera(大兆)和很多的實(shí)驗(yàn)室科研人員進(jìn)行了溝通,從基層科研人員的角度了解了更多一線人員和機(jī)構(gòu)面臨的痛點(diǎn)。Bigtera(大兆)的軟件定義存儲(chǔ)系統(tǒng)架構(gòu)平臺(tái)可以從多方面解決現(xiàn)行業(yè)研究中面臨的各種技術(shù)難點(diǎn)。
1、利用納管已有IT和存儲(chǔ),增加算力和存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn),秒級(jí)上線;
2、通過各種工具、算法隔離用戶保證節(jié)點(diǎn)獨(dú)立運(yùn)行快速構(gòu)建環(huán)境分析能力;
3、硬件故障通知與定位快讀自愈恢復(fù),熱冷溫?cái)?shù)據(jù)分層存儲(chǔ)保障數(shù)據(jù)安全;
4、私有云pipeline管理系統(tǒng),保證研究結(jié)果的一致性和穩(wěn)定性;
5、設(shè)定角色賬號(hào)自動(dòng)配置網(wǎng)絡(luò)存儲(chǔ)資源;
6、資源配額管理靈活合理分配,節(jié)約經(jīng)費(fèi),按需買單;
7、小型設(shè)備及高性能靜音設(shè)備,可為用戶提供放在手邊的生物信息分析系統(tǒng),無需專業(yè)機(jī)房;
目前針對(duì)生物信息大數(shù)據(jù)特別是基因測(cè)序場(chǎng)景對(duì)于IT基礎(chǔ)環(huán)境的應(yīng)用需求,Bigtera(大兆)與合作伙伴一起可以提供生信大數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的一站式解決方案。方案集高性能計(jì)算、海量存儲(chǔ)以及先進(jìn)、靈活的并行系統(tǒng)于一體,內(nèi)嵌200多種分析工具,指令級(jí)環(huán)境動(dòng)態(tài)加載能力,完美適配各類分析算法需求。實(shí)現(xiàn)IT與業(yè)務(wù)相剝離,大大降低IT使用門檻,使研究人員可以更加專注于自己的科研工作。
生物信息學(xué)領(lǐng)域是致力于研究人類生命健康發(fā)展的規(guī)模宏大的學(xué)術(shù)領(lǐng)域,是以計(jì)算機(jī)為工具對(duì)生物信息進(jìn)行存儲(chǔ)、檢索和分析的科學(xué)同時(shí)也是是當(dāng)今重要的科研領(lǐng)域之一。Bigtera(大兆)作為軟件定義存儲(chǔ)系統(tǒng)技術(shù)平臺(tái)的創(chuàng)新者,從2015年起一直致力于生物信息行業(yè)的業(yè)務(wù)發(fā)展。目前已經(jīng)和很多高校、實(shí)驗(yàn)室以及研究機(jī)構(gòu)進(jìn)行了合作,具有豐富的技術(shù)經(jīng)驗(yàn)和業(yè)務(wù)模型。健康中國(guó)關(guān)系著每個(gè)個(gè)人、家庭,企業(yè)及全社會(huì)的發(fā)展,Bigtera(大兆)未來也將在生物信息行業(yè)中以穩(wěn)定先進(jìn)及不斷創(chuàng)新的技術(shù)和服務(wù),支持大健康產(chǎn)業(yè)的持續(xù)發(fā)展。