北京2024年11月21日 /美通社/ -- 自成立以來，擎科生物始終致力于為全球科研人員提供卓越的核酸合成類服務(wù)與產(chǎn)品。隨著公司在全球范圍內(nèi)的持續(xù)發(fā)展，我們不斷見證客戶的研究成果在頂級期刊上的亮眼表現(xiàn)。
本期，我們精心挑選了10篇發(fā)布于Cell、Science和Molecular Cancer等知名期刊的學(xué)術(shù)文章，涵蓋基因功能研究、疾病診斷與治療等領(lǐng)域，這些研究展示了擎科生物產(chǎn)品在生命科學(xué)領(lǐng)域中的廣泛應(yīng)用與深遠(yuǎn)影響。
部分高分文章解讀
使用擎科產(chǎn)品： 引物合成
1
文章題目：Transport mechanism and pharmacology of the human GlyT1
DOI: 10.1016/j.cell.2024.02.026
期刊：Cell
影響因子：64.5
內(nèi)容概要：
研究表明，甘氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)體1（GlyT1）在抑制性和興奮性神經(jīng)傳遞的調(diào)控中發(fā)揮關(guān)鍵作用，通過從突觸間隙中移除甘氨酸來實(shí)現(xiàn)這一功能。由于其與谷氨酸/甘氨酸共激活的NMDA受體（NMDARs）密切相關(guān)，GlyT1已成為治療與NMDAR功能不足相關(guān)的精神分裂癥的核心靶點(diǎn)。本研究探索了GlyT1與底物甘氨酸及藥物ALX-5407、SSR504734和PF-03463275結(jié)合的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)，展示了轉(zhuǎn)運(yùn)循環(huán)的三個(gè)基本狀態(tài)：向外開放狀態(tài)、閉合狀態(tài)和向內(nèi)開放狀態(tài)，詳細(xì)描繪與甘氨酸再攝取相關(guān)的構(gòu)象變化。此外，該研究還識別了三個(gè)特定口袋用于容納藥物，提供了其抑制機(jī)制和選擇性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。這些結(jié)構(gòu)綜合起來為理解GlyT1的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制以及底物和抗精神分裂癥藥物的識別提供了重要見解，從而為設(shè)計(jì)治療精神分裂癥的小分子藥物奠定了基礎(chǔ)。
2
文章題目：Catalytically inactive long prokaryotic Argonaute systems employ distinct effectors to confer immunity via abortive infection
DOI：10.1038/s41467-023-42793-3
期刊：Nature Communications
影響因子: 16.6
內(nèi)容概要：
研究表明，Argonaute蛋白（Agos）通過結(jié)合短核酸作為向?qū)В灰龑?dǎo)識別目標(biāo)互補(bǔ)核酸。多樣的原核生物Argonaute蛋白（pAgos）在微生物防御中可能發(fā)揮潛在功能。然而，一組全長但催化不活躍的pAgos，即長B型pAgos，其功能和機(jī)制尚不清楚。研究發(fā)現(xiàn)大多數(shù)長B型pAgos功能上與不同的相關(guān)蛋白質(zhì)相連接，包括核酸酶、含Sir2結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)和跨膜蛋白質(zhì)。長B型pAgo-核酸酶系統(tǒng)（BPAN）通過向?qū)NA引導(dǎo)的目標(biāo)DNA識別而被激活，并在體外執(zhí)行旁側(cè)DNA降解。在體內(nèi)，該系統(tǒng)在感知入侵質(zhì)粒后介導(dǎo)基因組DNA降解，導(dǎo)致被感染細(xì)胞的死亡，從而從細(xì)胞群體中消除入侵者?？傊?，BPAN系統(tǒng)通過流產(chǎn)性感染提供免疫保護(hù)。其他配備不同相關(guān)蛋白質(zhì)的長B型pAgos也采用類似的防御策略。
產(chǎn)品直通車：
擎科生物在全國布局了20多個(gè)常規(guī)Oligo產(chǎn)品的生產(chǎn)基地，實(shí)現(xiàn)次日交付，可快速地為客戶提供全品類寡核苷酸一站式合成服務(wù)！
使用擎科產(chǎn)品： siRNA
3
文章題目：CircPPAP2B controls metastasis of clear cell renal cell carcinoma via HNRNPC-dependent alternative splicing and targeting the miR-182-5p/CYP1B1 axis
DOI: 10.1186/s12943-023-01912-w
期刊：Molecular Cancer
影響因子: 37.3
內(nèi)容概要：
該研究探索了環(huán)狀RNA circPPAP2B在透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌（ccRCC）中的作用及其調(diào)控機(jī)制。腎細(xì)胞癌（RCC）是全球常見的惡性腫瘤之一，轉(zhuǎn)移是RCC相關(guān)死亡的主要原因。環(huán)狀RNA（circRNA）在癌癥轉(zhuǎn)移中具有重要調(diào)控作用，但其在RCC中的功能和機(jī)制尚不明確。
研究發(fā)現(xiàn)circPPAP2B在高侵襲性ccRCC細(xì)胞和轉(zhuǎn)移性ccRCC組織中高表達(dá)，并與預(yù)后不良相關(guān)。功能實(shí)驗(yàn)表明，circPPAP2B促進(jìn)ccRCC細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。機(jī)制研究顯示，circPPAP2B通過m6A依賴方式與HNRNPC相互作用，促進(jìn)其核轉(zhuǎn)位，并調(diào)節(jié)HNRNPC與剪接因子PTBP1和HNPNPK的相互作用，影響前mRNA選擇性剪接。此外，circPPAP2B作為miRNA海綿，結(jié)合miR-182-5p，增加CYP1B1的表達(dá)。揭示了circPPAP2B通過HNRNPC依賴的選擇性剪接和miR-182-5p/CYP1B1軸促進(jìn)ccRCC增殖和轉(zhuǎn)移，強(qiáng)調(diào)了circPPAP2B作為ccRCC治療靶點(diǎn)的潛力。
4
文章題目：CD97 negatively regulates the innate immune response against RNA viruses by promoting RNF125-mediated RIG-I degradation
DOI: 10.1038/s41423-023-01103-z
期刊：Cell Mol Immunol
影響因子: 24.1
內(nèi)容概要：
本研究發(fā)現(xiàn)，G蛋白偶聯(lián)受體ADGRE5（CD97）能夠結(jié)合多種在代謝中發(fā)揮重要調(diào)控作用的代謝物。然而，其在抗病毒先天免疫反應(yīng)中的功能尚未明確。研究報(bào)告了CD97抑制病毒誘導(dǎo)的I型干擾素（IFN-I）釋放，并在細(xì)胞和小鼠中增強(qiáng)RNA病毒復(fù)制的情況。CD97被確定為先天免疫受體RIG-I的新負(fù)調(diào)控因子，RIG-I的降解導(dǎo)致了IFN-I信號通路的抑制。此外，CD97的過表達(dá)促進(jìn)了RIG-I的泛素化，從而導(dǎo)致其降解，但并不影響其mRNA的表達(dá)。在機(jī)制上，CD97通過上調(diào)RNF125的表達(dá)，誘導(dǎo)RNA病毒感染后RNF125介導(dǎo)的K48連接泛素化在Lys181位點(diǎn)的RIG-I降解。最重要的是，與野生型小鼠相比，缺乏CD97的小鼠對RNA病毒感染更具抵抗力。研究發(fā)現(xiàn)，血根堿介導(dǎo)的CD97抑制能夠有效阻止VSV和SARS-CoV-2的復(fù)制。這些發(fā)現(xiàn)闡明了CD97在抗病毒先天免疫反應(yīng)中負(fù)調(diào)控RIG-I的未知機(jī)制，并為新治療策略的開發(fā)和靶向抗病毒藥物的設(shè)計(jì)提供了分子基礎(chǔ)。
產(chǎn)品直通車：
擎科生物可以提供高品質(zhì) siRNA產(chǎn)品合成服務(wù)，純度高，毒性低，所有產(chǎn)品經(jīng)質(zhì)譜檢測，保證序列準(zhǔn)確性，為實(shí)驗(yàn)提供有力保障。
使用擎科產(chǎn)品：sgRNA
5
文章題目：Engineered Extracellular Vesicle-Delivered CRISPR/Cas9 for Radiotherapy Sensitization of Glioblastoma
DOI: 10.1021/acsnano.2c12857
期刊：ACS Nano
影響因子: 17.1
內(nèi)容概要：
該研究通過在小鼠體內(nèi)的原位腫瘤中進(jìn)行全基因組CRISPR敲除篩選，識別出與放療相關(guān)的合成致死基因。通過功能篩選和轉(zhuǎn)錄組分析，發(fā)現(xiàn)谷胱甘肽合成酶（GSS）可能是通過鐵死亡調(diào)控放射抗性的潛在因子。高水平的GSS與膠質(zhì)瘤患者的不良預(yù)后和復(fù)發(fā)密切相關(guān)。機(jī)制研究表明，GSS與抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞放射治療誘導(dǎo)的鐵死亡有關(guān)。GSS的缺失導(dǎo)致谷胱甘肽（GSH）合成中斷，進(jìn)而引起GPX4失活和鐵積累，從而增強(qiáng)了放射治療引發(fā)的鐵死亡。此外，為了克服CRISPR編輯廣泛治療應(yīng)用的障礙，研究報(bào)告了一種新型基因編輯遞送系統(tǒng)，其中將Cas9蛋白/sgRNA復(fù)合物裝載入修飾有Angiopep-2（Ang）和轉(zhuǎn)錄激活因子（TAT）肽的雙修飾細(xì)胞外囊泡（EV）中，該系統(tǒng)不僅靶向血腦屏障（BBB）和GBM，還能夠穿透BBB并滲透腫瘤。研究所開發(fā)的囊泡在GBM組織中顯示出良好的靶向效果，使GSS基因編輯效率達(dá)到67.2%，且?guī)缀鯖]有非靶向基因編輯。這些結(jié)果表明，將無偏基因篩選與CRISPR-Cas9基因療法結(jié)合，可以有效識別潛在的合成致死基因，從而擴(kuò)展治療靶點(diǎn)。
產(chǎn)品直通車：
擎科生物可提供穩(wěn)定性強(qiáng)、編輯效率高的化學(xué)合成sgRNA，純化方式可選，同時(shí)在sgRNA的3'和5'端各加3個(gè)硫代和甲氧基修飾，有效提高sgRNA穩(wěn)定性，從而降低脫靶效應(yīng)，解決基因編輯不穩(wěn)定、效果差等難題。
使用擎科產(chǎn)品： 基因合成
6
文章題目：Enhancing rice panicle branching and grain yield through tissue-specific brassinosteroid inhibition
DOI: 10.1126/science.adk8838
期刊：Science
影響因子：56.9
內(nèi)容概要：
該研究表明，作物產(chǎn)量潛力受限于諸如籽粒大小與數(shù)量之間的固有權(quán)衡。雖然油菜素內(nèi)酯（BRs）能促進(jìn)籽粒增大，但其在調(diào)節(jié)籽粒數(shù)量方面的作用尚不明確。通過解析簇穗水稻種質(zhì)，研究發(fā)現(xiàn)激活BR代謝基因BRASSINOSTEROID-DEFICIENT DWARF3（BRD3）顯著增加籽粒數(shù)量。建立了一個(gè)分子通路，其中BR信號抑制因子GSK3/SHAGGY-LIKE KINASE2磷酸化并穩(wěn)定了OsMADS1轉(zhuǎn)錄因子，該轉(zhuǎn)錄因子靶向TERMINAL FLOWER1樣基因RICE CENTRORADIALIS2。在次級分枝分生組織中特異性激活BRD3能增強(qiáng)穗狀分枝，減少對籽粒大小的負(fù)面影響，并提高籽粒產(chǎn)量。研究展示了組織特異性激素操縱在打破各種性狀之間的權(quán)衡并釋放水稻產(chǎn)量潛力方面的強(qiáng)大作用。
7
文章題目：Targeting carnitine palmitoyl transferase 1A (CPT1A) induces ferroptosis and synergizes with immunotherapy in lung cancer
DOI: 10.1038/s41392-024-01772-w
期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy
影響因子：39.3
內(nèi)容概要：
盡管免疫檢查點(diǎn)療法取得了一定成功，肺癌中無反應(yīng)或復(fù)發(fā)現(xiàn)象依然普遍存在。研究發(fā)現(xiàn)，癌癥干細(xì)胞（CSCs）是免疫療法相關(guān)耐藥的重要因素。鐵死亡是一種由鐵依賴性脂質(zhì)過氧化驅(qū)動的細(xì)胞死亡形式，通過細(xì)胞代謝重塑高度調(diào)控，已顯示出與免疫療法結(jié)合的協(xié)同效果。CSCs的代謝適應(yīng)推動了腫瘤耐藥性，但其在腫瘤免疫逃逸中抵抗鐵死亡的機(jī)制尚不清楚。研究通過代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、肺上皮特異性Cpt1a敲除小鼠模型和臨床分析，證明了脂肪酸氧化的關(guān)鍵限速酶CPT1A與來源于腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的L-肉堿共同驅(qū)動肺癌中鐵死亡耐受和CD8+ T細(xì)胞失活。在機(jī)制上，CPT1A抑制c-Myc的泛素化和降解，而c-Myc則轉(zhuǎn)錄激活CPT1A表達(dá)。CPT1A/c-Myc正反饋環(huán)通過激活NRF2/GPX4系統(tǒng)和下調(diào)ACSL4減少磷脂多不飽和脂肪酸的數(shù)量，進(jìn)一步增強(qiáng)細(xì)胞抗氧化能力，從而抑制CSCs中的鐵死亡。重要的是，靶向CPT1A能增強(qiáng)免疫檢查點(diǎn)阻斷誘導(dǎo)的抗腫瘤免疫力和腫瘤負(fù)載小鼠的腫瘤鐵死亡。這些結(jié)果展示了一種通過靶向CSCs鐵死亡中的代謝脆弱性來改善肺癌免疫療法療效的機(jī)制導(dǎo)向治療策略的潛力。
8
文章題目：Abiotic Synthetic Antibody Inhibitor with Broad-Spectrum Neutralization and Antiviral Efficacy against Escaping SARS-CoV?2 Variants
DOI: 10.1021/acsnano.3c02050
期刊：ACS Nano
影響因子：17.1
內(nèi)容概要：
該研究針對新冠病毒（SARS-CoV-2）疫苗和抗體逃逸變種的快速出現(xiàn)和傳播所帶來的挑戰(zhàn)，提出了一種潛在的治療策略。研究人員開發(fā)了一種人工合成的抗體抑制劑，名為Aphe-NP14，作為抗新冠病毒的治療劑。Aphe-NP14從一個(gè)合成水凝膠聚合物納米顆粒庫中篩選而出，該庫通過結(jié)合與新冠病毒刺突蛋白受體結(jié)合域（RBD）關(guān)鍵殘基相互作用的單體功能性基團(tuán)構(gòu)建而成。Aphe-NP14在生物相關(guān)條件下表現(xiàn)出高容量、快速吸附動力學(xué)、強(qiáng)親和力和廣泛特異性，能有效中和包括Beta、Delta和Omicron在內(nèi)的多種新冠病毒變種。通過阻斷刺突蛋白RBD與人類血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2（ACE2）的相互作用，Aphe-NP14能夠抑制這些逃逸變種病毒的感染。研究還發(fā)現(xiàn)，Aphe-NP14通過鼻腔給藥具有較低的體內(nèi)外毒性，表明其在新冠病毒變種的預(yù)防和治療方面具有潛在應(yīng)用價(jià)值。
產(chǎn)品直通車：
擎科生物根植于經(jīng)驗(yàn)豐富的基因合成技術(shù)，搭建基因智能分子拆分及組裝技術(shù)平臺，有效提高拆分正確率和一次組裝成功率；結(jié)合多年的生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn)以及專業(yè)的生命科學(xué)、生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等學(xué)科背景開發(fā)深度密碼子優(yōu)化技術(shù)，同時(shí)，依托螺旋槳系統(tǒng)（TSINGKE HELIXTECH），這一集成了客戶服務(wù)、生產(chǎn)管理和精益管理的全周期管理系統(tǒng)，將AI算法應(yīng)用于原料、設(shè)備和工藝的串聯(lián)，搭建了智能化生產(chǎn)線，并通過精準(zhǔn)的基因檢測質(zhì)檢技術(shù)，共同實(shí)現(xiàn)了低成本、高效率、高品質(zhì)的基因合成服務(wù)，滿足生命科學(xué)研究、生物制藥、生物育種、生物制造、基因存儲等領(lǐng)域的需求。
使用擎科產(chǎn)品：shRNA質(zhì)粒
9
文章題目：Targeting gut microbial nitrogen recycling and cellular uptake of ammonium to improve bortezomib resistance in multiple myeloma
DOI: 10.1016/j.cmet.2023.11.019
期刊：Cell Metabolism
影響因子: 29
內(nèi)容概要：
本研究發(fā)現(xiàn)腸道微生物群在多發(fā)性骨髓瘤（MM）治療中起著關(guān)鍵作用，而多發(fā)性骨髓瘤由于耐藥性仍被認(rèn)為是不可治愈的。發(fā)現(xiàn)腸道中的氮循環(huán)細(xì)菌在MM患者中有所富集。然而，這些細(xì)菌在MM復(fù)發(fā)中的作用仍不清楚。本研究強(qiáng)調(diào)了復(fù)發(fā)性MM患者中特定富集的弗氏檸檬酸桿菌（Citrobacter freundii，C. freundii）。通過糞菌移植實(shí)驗(yàn)，證明了C. freundii通過增加循環(huán)氨水平在MM中誘導(dǎo)耐藥性起著關(guān)鍵作用。氨通過跨膜通道蛋白SLC12A2進(jìn)入MM細(xì)胞，穩(wěn)定NEK2蛋白，從而促進(jìn)染色體不穩(wěn)定性和耐藥性。還發(fā)現(xiàn)環(huán)利尿劑呋塞米鈉能夠下調(diào)SLC12A2，抑制MM細(xì)胞對氨的攝取，提高無進(jìn)展生存期和治療效果評分。這些發(fā)現(xiàn)為干預(yù)MM進(jìn)展和耐藥性提供了新的治療靶點(diǎn)和策略。
10
文章題目：Targeting FAPα-positive lymph node metastatic tumor cells suppresses colorectal cancer metastasis
DOI：10.1016/j.apsb.2023.11.002
期刊：APSB
影響因子：14.5
內(nèi)容概要：
研究發(fā)現(xiàn)，淋巴轉(zhuǎn)移是結(jié)直腸癌的主要轉(zhuǎn)移途徑，這增加了癌癥復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)。淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌（LNM-CRC）細(xì)胞的特性尚不完全了解，且缺乏有效的治療方法。研究發(fā)現(xiàn)，缺氧條件下LNM-CRC細(xì)胞中纖維母細(xì)胞活化蛋白α（FAPα）的表達(dá)增加。通過功能增益或缺失實(shí)驗(yàn)表明，F(xiàn)APα通過激活STAT3通路，增強(qiáng)了腫瘤細(xì)胞的遷移、侵襲、上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化、干性和淋巴管生成。此外，腫瘤細(xì)胞中的FAPα通過招募調(diào)節(jié)性T細(xì)胞誘導(dǎo)細(xì)胞外基質(zhì)重塑，并建立免疫抑制環(huán)境，從而促進(jìn)結(jié)直腸癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移（CRCLNM）。FAPα激活的前藥Z-GP-DAVLBH通過靶向FAPα陽性的LNM-CRC細(xì)胞抑制了CRCLNM。研究強(qiáng)調(diào)了FAPα在CRCLNM中的作用，并提供了一個(gè)潛在的治療靶點(diǎn)和有前景的治療策略。
產(chǎn)品直通車：
擎科生物憑借豐富的載體構(gòu)建經(jīng)驗(yàn)，為客戶提供高品質(zhì)的shRNA載體構(gòu)建服務(wù)，年合成量大、效率有保障。我們采用無復(fù)制能力的慢病毒載體來表達(dá)shRNA，可根據(jù)需求選擇直接轉(zhuǎn)染shRNA質(zhì)?；?qū)⑵浒b成慢病毒顆粒后感染靶細(xì)胞。載體中的抗性標(biāo)記（如PURO/NEO）簡化了穩(wěn)轉(zhuǎn)株篩選過程，同時(shí)熒光標(biāo)記（如GFP/RFP）不僅方便觀察轉(zhuǎn)染/感染效率，還能輔助流式細(xì)胞術(shù)篩選，提升實(shí)驗(yàn)效率與精準(zhǔn)度。
通過這些前沿研究的展示，我們不僅見證了擎科生物產(chǎn)品在生命科學(xué)研究中的廣泛應(yīng)用，也體現(xiàn)了公司在推動科學(xué)進(jìn)步方面的堅(jiān)定承諾。擎科生物將繼續(xù)依托創(chuàng)新的基因合成技術(shù)和卓越的服務(wù)，致力于為全球科研人員提供更加高效、精準(zhǔn)的解決方案。我們期待與更多的科研伙伴攜手合作，共同推動科學(xué)探索的邊界，為全球生命科學(xué)的發(fā)展貢獻(xiàn)力量。
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