北京2017年11月20日電 /美通社/ -- 自精準(zhǔn)醫(yī)療提出以來，國內(nèi)外涌現(xiàn)出一大批生物基因檢測(cè)公司，開展基因檢測(cè)服務(wù)。通過高通量測(cè)序已經(jīng)積累的龐大基因數(shù)據(jù)，為疾病診斷、分型、藥物研發(fā)等提供了新方向及工具。但隨著海量基因及健康數(shù)據(jù)的產(chǎn)生，企業(yè)在數(shù)據(jù)管理的需求上面臨著巨大的壓力和挑戰(zhàn)，如何精細(xì)化運(yùn)營這些數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)匹配應(yīng)用，隨之有效進(jìn)行存儲(chǔ)和管理，逐漸成為生物基因公司共同面臨的問題。
11月17日，由榮之聯(lián)和英特爾聯(lián)合主辦的“基因大數(shù)據(jù)平臺(tái)應(yīng)用實(shí)踐高峰論壇”在國家游泳中心北五環(huán)咖啡館順利召開。本次論壇圍繞生物基因大數(shù)據(jù)平臺(tái)應(yīng)用實(shí)踐，眾多技術(shù)專家就基因數(shù)據(jù)的有效管理和應(yīng)用等話題展開討論。
測(cè)序中國聯(lián)合創(chuàng)始人、COO商元博主持了本次論壇。
極道科技聯(lián)合創(chuàng)始人、總經(jīng)理吳江，是國內(nèi)知名的存儲(chǔ)系統(tǒng)、分布式數(shù)據(jù)系統(tǒng)專家，中國計(jì)算機(jī)協(xié)會(huì)信息存儲(chǔ)專業(yè)委員會(huì)委員。吳江在“生物信息應(yīng)用驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)系統(tǒng)”的報(bào)告中，講到極道科技的生物數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng)，包括存、管、算、察四方面及其生物數(shù)據(jù)流，目的就是要實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的有效存儲(chǔ)、發(fā)現(xiàn)、調(diào)度和轉(zhuǎn)化。吳江表示：“單獨(dú)的基因組數(shù)據(jù)文件并不是有效的大數(shù)據(jù)，還需要結(jié)合臨床表型數(shù)據(jù)。沒有完美存儲(chǔ)，只有合適的應(yīng)用。目前，沒有任何一種存儲(chǔ)方式可以解決所有的需求問題，我們要用計(jì)算換空間，還要重視數(shù)據(jù)感知。”
Intel 公司亞太區(qū)生命科學(xué)業(yè)務(wù)負(fù)責(zé)人李健，是“英特爾精準(zhǔn)醫(yī)療伙伴計(jì)劃”的主要發(fā)起者和負(fù)責(zé)人，他的報(bào)告題目為“精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)算領(lǐng)域的機(jī)遇挑戰(zhàn)與方案創(chuàng)新”。在報(bào)告中，李健表示，近幾年，大批跨界巨頭涌入基因行業(yè)的驅(qū)動(dòng)力就是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)?；蛐袠I(yè)的快速發(fā)展正是因?yàn)楦鞣N實(shí)際和潛在的應(yīng)用需求。李健分析了目前全球精準(zhǔn)醫(yī)療市場(chǎng)面臨的機(jī)遇與挑戰(zhàn)，并提出了應(yīng)對(duì)對(duì)策，最后李健表示，希望業(yè)內(nèi)能夠以一個(gè)開放的心態(tài)，共享標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)，進(jìn)一步挖掘數(shù)據(jù)價(jià)值。英特爾的愿景就是和中國生態(tài)伙伴協(xié)作創(chuàng)新，力促實(shí)現(xiàn)“24小時(shí)精準(zhǔn)醫(yī)療”。
Intel 公司醫(yī)療與生命科學(xué)部首席架構(gòu)師丁華，專注于醫(yī)療與生命科學(xué)領(lǐng)域的解決方案和應(yīng)用模式的創(chuàng)新，負(fù)責(zé)英特爾在生命科學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的技術(shù)解決方案。丁華的報(bào)告題目同樣為“精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)算領(lǐng)域的機(jī)遇挑戰(zhàn)與方案創(chuàng)新”，簡要分析了目前行業(yè)內(nèi)的挑戰(zhàn)，包括規(guī)模、速讀、調(diào)度和拓展四方面。通過應(yīng)用實(shí)例詳細(xì)介紹了英特爾目前的研究進(jìn)展，丁華表示英特爾推出的 BIGstack 一體機(jī)平臺(tái)的初衷就是，創(chuàng)造一個(gè)經(jīng)過驗(yàn)證的 GATK 環(huán)境，使硬件設(shè)施有參考，實(shí)現(xiàn)來源共享，最終推動(dòng)行業(yè)的發(fā)展。
中科晶云副總經(jīng)理孫亮博士，中科院計(jì)算所副研究員，中科信息產(chǎn)業(yè)研究院精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究所副所長，主要研究領(lǐng)域：機(jī)器學(xué)習(xí)、大數(shù)據(jù)分析挖掘、生物信息軟件研發(fā)等，孫亮博士為大家報(bào)告了“組學(xué)數(shù)據(jù)解讀的私有云解決方案”。孫亮博士簡要介紹了生物信息在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中的重要作用，詳細(xì)介紹了中科晶云的私有云系統(tǒng)。孫博士表示晶云的存儲(chǔ)、分析、解讀云平臺(tái)面向兩類分析場(chǎng)景：基因遺傳病遺傳學(xué)分析和基因遺傳病系譜分析，直擊最可能的致病變異，讓報(bào)告更加完善。晶云從始至終，專注做好收集、存儲(chǔ)、分析、解讀臨床數(shù)據(jù)，對(duì)疾病精準(zhǔn)分型，實(shí)現(xiàn)更好的個(gè)性化健康管理。
烈冰生物創(chuàng)始人、技術(shù)總監(jiān)宗杰博士，專注于基因組測(cè)序和基因組學(xué)相關(guān)的生物信息數(shù)據(jù)分析、算法開發(fā)、數(shù)據(jù)庫構(gòu)建和平臺(tái)搭建工作，帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了國內(nèi)領(lǐng)先的基因測(cè)序云計(jì)算平臺(tái) NovelBrainTM。宗杰博士以“基因數(shù)據(jù)在云端遇到的那些坑”為題進(jìn)行報(bào)告，簡單介紹了烈冰科技云平臺(tái)的發(fā)展歷史，概述了烈冰云平臺(tái)的優(yōu)勢(shì)，包括高度定制化、隨時(shí)添加 panel 運(yùn)行、CPU 實(shí)時(shí)監(jiān)控等。宗杰博士重點(diǎn)講述了烈冰科技云平臺(tái)在上線過程中遇到的問題和困難實(shí)例，并用幽默風(fēng)趣的方式分析了對(duì)應(yīng)的解決與改進(jìn)方案。
在最后的圓桌論壇中，吳江，李健，丁華，孫亮博士，宗杰博士，安諾優(yōu)達(dá)技術(shù)總監(jiān)楊吉濤博士等各位技術(shù)專家就“未來生物基因數(shù)據(jù)如何精準(zhǔn)有效的管理”進(jìn)行了多輪討論，并分別發(fā)表了獨(dú)到的見解。
