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深圳2023年8月7日 /美通社/ -- 日前,國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt亞洲分站(https://nextprot.cn/)由深圳承啟生物科技有限公司(下稱承啟生物)建設(shè)完成,提供全功能的公共服務(wù)。這標(biāo)志著中國(guó)擁有全部的人類蛋白質(zhì)組公共數(shù)據(jù),將極大地提升中國(guó)和其他亞洲國(guó)家利用人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃成果的便捷性,助力人類健康和疾病的研究。
國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(Human Proteome Project)是人類基因組計(jì)劃之后的又一重大國(guó)際合作大科學(xué)計(jì)劃,旨在鑒定所有人類基因組編碼蛋白,繪制人體蛋白質(zhì)圖譜,作為研究蛋白質(zhì)分子功能、推進(jìn)疾病的診斷和治療的重要資源。相比于人類基因組計(jì)劃時(shí)中國(guó)僅負(fù)責(zé)1%的測(cè)序工作,中國(guó)科學(xué)家在人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃中的參與程度有了質(zhì)的飛躍。目前,中國(guó)科學(xué)家負(fù)責(zé)了人類三條染色體上的蛋白質(zhì)研究,分別是1號(hào)染色體、8號(hào)染色體、20號(hào)染色體。2022年起,暨南大學(xué)教授、承啟生物首席科學(xué)家張弓博士被選為國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的常委,是唯一來自亞洲的常委。
國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃所產(chǎn)生的人類蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)載于neXtProt數(shù)據(jù)庫(www.nextprot.org),是目前人類蛋白質(zhì)組最權(quán)威的數(shù)據(jù)庫,由瑞士生物信息學(xué)研究院(Swiss Institute of Bioinformatics)建立和維護(hù)。隨著中國(guó)科學(xué)界對(duì)蛋白質(zhì)組高質(zhì)量資源的需求與日俱增,洲際訪問neXtProt數(shù)據(jù)庫常常遇到速度緩慢和卡死狀況。為此,承啟生物從2021年末起承建neXtProt數(shù)據(jù)庫的亞洲分站(https://nextprot.cn/)。但由于中國(guó)和歐洲的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境差異巨大,承啟生物做了許多調(diào)整與更改,復(fù)刻了主站的全部?jī)?nèi)容與結(jié)構(gòu),方便用戶的使用習(xí)慣。同時(shí),兩個(gè)數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容也會(huì)定期同步。亞洲分站的建設(shè)完成,將大大提升中國(guó)和其他亞洲國(guó)家利用這些高質(zhì)量蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)的便捷程度,對(duì)人類蛋白質(zhì)的研究、疾病機(jī)制研究和藥物開發(fā)起到顯著的推動(dòng)作用。
承啟生物是HUPO(人類蛋白質(zhì)組組織)的長(zhǎng)期合作伙伴,在人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃中有很大的投入。承啟生物以高精度的大規(guī)模測(cè)序比對(duì)算法FANSe系列和翻譯組測(cè)序技術(shù)(含RNC-seq, Ribo-seq)享譽(yù)業(yè)界,并為人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃免費(fèi)提供翻譯組測(cè)序服務(wù)。